Институт философии, политологии и религиоведения КН МОН РК с 2013 года выполняет научно-исследовательские проекты, утвержденные приказом Руководителя Администрации Президента №01-38.42 от 11 июля 2013 года «Об утверждении Тематического плана исследовательских работ на 2013-2015 годы» по направлению «Ценности и идеалы независимого Казахстана» по пунктам 21-32 (12 тем).

В 2013 году начали реализовываться 9 тем, в 2014 году они же были продолжены и добавлены 2 новые темы. 1 тема по разработке и изданию Терминологического справочника «Казахстан-2050» в 2014 году была снята с контроля Администрации Президента РК как завершенная работа.

Институт является головной организацией программы «Ценности и идеалы независимого Казахстана» в рамках реализации Тематического плана исследований «Стратегия «Казахстан-2050», из 11 тем осуществляет 6 проектов:

1. «Фундаментальные причины и проявления кризиса ценностей цивилизации: риски, влияние на Казахстан, возможности преодоления»;
2. «Новый казахстанский патриотизм: суть и новизна, новые подходы и приоритеты к формированию, барьеры, практические рекомендации»;
3. «Оценка религиозного сознания: основные проблемы и рекомендации по совершенствованию религиозной политики»;
4. «Традиционная религия для Казахстана: суть и отличие суннизма ханафитского мазхаба»;
5. «Анализ социально-политической стратификации казахстанского общества (социальный патернализм и иждивенческие настроения)»;
6. «Основные факторы социальной напряженности и протестности на региональном уровне (мониторинг протестной активности и социальной напряженности в регионах)».